卫理青团神学教育基金乃由砂拉越华人年议会青年团契所设立的。其思想缘由于第十一届(1997-1998年)年会青团为了鼓励属下牧区团契支持神学教育而发动筹募诗巫卫理神学院图书馆书架费用(马币两万六千多)。显然卫理青年乐意以金钱援助神学教育工作。
有鉴于此,第十二届(1999-2000年)年会青团又在林忠锦牧师的指导之下,推展筹备青年神学教育基金。目标为马币五万元。事后,蒙年会青团第十三届代表大会通过将从各教区(诗巫教青例外)属下各牧区青团提呈来的款项与存放已久的青年工作者基金(RM37,105.79)合拼成为卫理青团神学教育基金(RM70,000)。